Tennessee đã được nhận vào Hoa Kỳ sau cuộc bầu cử năm 1792, tăng Đại cử tri lên 138 đại cử tri.

Chiến dịch tập trung ở các bang quan trọng như New York và Pennsylvania. Adams và Jefferson đã giành được 139 phiếu bầu tổng hợp từ 138 thành viên của Đại cử tri đoàn. Những người Liên bang nhận phiếu mọi bang phía bắc của dòng Mason-Dixon, ngoại trừ Pennsylvania. Tuy nhiên, một cử tri bầu cử ở Pennsylvania đã bỏ phiếu cho Adams. Đảng Dân chủ Cộng hòa đã giành được phiếu bầu của hầu hết các đại cử tri miền Nam, nhưng các đại cử tri của Maryland và Delaware đã dành phần lớn phiếu bầu cho các ứng cử viên Liên bang, trong khi cử tri Bắc Carolina và Virginia đều cho Adams một phiếu bầu.

Trên toàn quốc, hầu hết các đại cử tri đã bỏ phiếu cho Adams và một người Liên bang thứ hai hoặc cho Jefferson và một người Dân chủ Cộng hòa thứ hai, nhưng có một số trường hợp ngoại lệ cho quy tắc này. Một cử tri ở Maryland đã bỏ phiếu cho cả Adams và Jefferson, và hai cử tri bỏ phiếu cho Washington, người đã không vận động và không chính thức liên kết với một trong hai bên. Pinckney đã giành được số phiếu thứ hai từ đa số cử tri đã bỏ phiếu cho Adams, nhưng 21 đại cử tri từ New England và Maryland đã bỏ phiếu thứ hai cho các ứng cử viên khác, bao gồm cả Chánh án Oliver Ellsworth. Những người đã bỏ phiếu cho Jefferson đã ít đoàn kết hơn đáng kể trong lựa chọn thứ hai của họ, mặc dù Burr đã giành được một số lượng lớn các cử tri của Tổng thống. Tất cả tám cử tri ở bang Nam Carolina của Pinckney, cũng như ít nhất một cử tri ở Pennsylvania, đã bỏ phiếu bầu của họ cho Jefferson và Pinckney. Ở Bắc Carolina, Jefferson đã giành được 11 phiếu, nhưng 13 phiếu còn lại được trải đều giữa sáu ứng cử viên khác nhau từ cả hai bên. Ở Virginia, hầu hết các đại cử tri đã bỏ phiếu cho Jefferson và Thống đốc Samuel Adams của Massachusetts.

Kết quả cuối cùng là Adams đã nhận được 71 phiếu đại cử tri, nhiều hơn một phiếu so với yêu cầu được bầu làm tổng thống. Nếu bất kỳ hai trong số ba đại cử tri Adams ở Pennsylvania, Virginia và Bắc Carolina đã bỏ phiếu cho những người khác thì Adams không thể thắng cử. Jefferson đã nhận được 68 phiếu bầu, nhiều hơn chín phiếu so với Pinckney và được bầu làm phó tổng thống. Burr kết thúc ở vị trí thứ tư xa với 30 phiếu. Chín cá nhân khác nhận được 48 phiếu bầu còn lại. Nếu Pinckney đã giành được phiếu bầu thứ hai của tất cả các đại cử tri ở New England đã bỏ phiếu cho Adams, thì ông ta sẽ được bầu làm tổng thống thay Adams và Jefferson.